Following a brief experiment with civilian rule, the Free Officers abrogated the 1953 constitution and declared Egypt a republic on 18 June 1953, Muhammad Naguib as Egypt's first President. بعد تجربة قصيرة مع الحكم المدني ألغى الضباط الأحرار دستور عام 1953 وأعلنوا النظام الجمهوري في 18 يونيو 1953 وأصبح محمد نجيب أول رئيس لمصر.
Farouk was forced to abdicate in favor of his infant son Ahmed-Fuad who became King Fuad II, while administration of the country passed to the Free Officers Movement under Muhammad Naguib and Gamal Abdel Nasser. اضطر فاروق للتنازل عن العرش لصالح ابنه الرضيع أحمد فؤاد الذي غدا الملك فؤاد الثاني، في حين انتقل حكم البلاد لحركة الضباط الأحرار تحت قيادة محمد نجيب وعبد الناصر.
Following the Egyptian Revolution of 1952, led by the Free Officers Movement of Muhammad Naguib and Gamal Abdel Nasser, in which the Egyptian monarchy was overthrown, the university began to be separated from the mosque. في أعقاب الثورة المصرية عام 1952، التي قامت بها حركة الضباط الأحرار بقيادة محمد نجيب وجمال عبد الناصر، والتي أدت إلى سقوط النظام الملكي المصري، خلال هذه الفترة تمت مراحل فصل الجامعة عن المسجد.